发布于: Oct 2, 2018

本 Quick Start 在大约 15 分钟内为 GENomics 完整套件 (DRAGEN CS) 在 AWS 云上部署动态读取分析,DRAGEN CS 是 Illumina 的一个数据分析平台。

DRAGEN CS 实现下一代测序 (NGS) 数据的超快速分析,显著缩短分析基因组数据所需的时间和提高准确度。它包括生物信息学管道,为映射、调整、排序、重复标记和单倍型变体识别提供高度优化的算法。这些管道包括 DRAGEN Germline V2、DRAGEN Somatic V2(肿瘤和肿瘤/正常)、DRAGEN 虚拟长读取检测 (VLRD)、DRAGEN RNA 基因融合、DRAGEN 联合基因分型和 GATK 最佳实践。

Quick Start 建立一个 AWS 环境,跨两个可用区实现高可用性,并为 Spot 实例和按需实例提供两个 AWS 批计算环境。这些环境包括 DRAGEN F1 实例,可连接到现场可编程门阵列 (FPGA) 以实现硬件加速。

要开始使用,请执行以下操作:

您可以从 GitHub 下载自动执行部署的 AWS CloudFormation 模板
 
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Quick Start 是一种自动化的参考部署,使用 AWS CloudFormation 模板按照 AWS 最佳实践在 AWS 上部署关键技术。本 Quick Start 由 Illumina 与 AWS 解决方案架构师联合构建。Illumina 是 AWS 高级技术合作伙伴。