只需几个命令行，就可以在几分钟内在 AWS 上建立像 Cromwell 和 Nextflow 这样的工作流程引擎，而无需更改现有代码或修改开源基因组学工具。
自动执行耗时的任务，比如配置和部署工作流程引擎、创建数据访问策略，以及优化计算集群以实现大规模操作。
以更高的规模和更少的时间运行基因组学工作流，从而减少了获得有用的洞察（如变异识别和疾病诊断）的时间。
不再主动维护亚马逊基因组学 CLI 项目代码，Github 存储库将于 2024 年 5 月 31 日存档。如果您正在寻找运行基因组学工作流程的服务，我们建议您探索 AWS HealthOmics 或联系您的 AWS 客户团队寻求替代解决方案。
工作原理
Amazon Genomics CLI 是适用于基因组学和生命科学客户的开源工具，可简化和自动化云基础设施的部署，从而为您提供一个易于使用的命令行界面，以在 WDL 等语言指定的 Amazon Web Services (AWS) 上快速设置和运行基因组学工作流。通过消除在云中设置和运行基因组学工作流程的繁重工作，软件开发人员和研究人员可以自动预置、配置和扩展云资源，以实现更快、更经济高效的人口遗传学研究、药物发现周期等等。
使用案例
精准医疗
支持对基因组测序数据进行分析，并在临床环境中应用研究结果，以改善人类健康。在群体层面，确定在病原体爆发期间易出现特定健康问题的群体或携带者。
药品发现和开发
利用人类遗传学和基因功能知识，使预防性治疗的开发和新药物发现成为可能。
环境基因组学
利用基因组测序数据来表征生物多样性，监测生态系统变化，并对有机体将如何在遗传水平上对环境水平的变化作出反应进行模型预测。