文档

  • 用户指南

    通过此分步开发人员指南了解如何使用 AWS HealthOmics。

  • API 参考

    阅读此参考指南,了解 AWS HealthOmics API 和参数。

教程

工具

工作流程工具

药物研发工作流程

使用此 AWS HealthOmics 工作流程集合来加速药物研发

示例工作流程

根据开源 HealthOmics 工作流程示例构建私有工作流程

Run Analyzer

Run Analyzer 是一款运行性能优化工具,可从 CloudWatch 检索运行清单日志并生成运行统计数据,包括每个工作流任务的 CPU 和内存利用率

WDL Linter

在运行工作流程之前,使用 HealthOmics WDL linter 检测常见的工作流程错误

Nextflow Linter

在运行工作流脚本之前检查常见的 Nextflow 错误

ECR 帮助程序

使用 ECR 帮助程序将现有容器迁移到您的私有 ECR 存储库

重新运行工具

从 CloudWatch 运行清单日志重新运行存档运行

数据存储工具

读取集传输管理器

从 AWS HealthOmics 参考资料或读取集轻松下载文件

事件驱动的导入程序

CDK 应用程序演示了一种事件驱动架构,当在 Amazon S3 中创建对象时,该架构会自动将数据导入 AWS HealthOmics 序列存储。

序列存储清单生成器

为 AWS HealthOmics 序列存储导入作业生成 JSON 清单

序列存储重复读取集查找器

识别存储在 AWS HealthOmics 序列存储中的重复读取集

解决方案

视频


克服与扩展组学分析相关的科学和 IT 挑战(22:11)


彻底改变精准医学:Sonrai 使用 AWS 进行药物研发(3:03)


AWS re:Invent 2023 — 利用 AWS HealthOmics 进行组学创新:Amgen 更快取得成果的途径


AWS re:Invent 2023 — 使用 AWS HealthOmics 构建精准医疗平台


AWS HealthOmics 端到端研讨会 — 演示(43:27)


AWS On Air 主题AWS HealthOmics 和开放数据(20:07)


使用 AWS HealthOmics 进行端到端基因组学(2:03:06)


AWS On Air 主题AWS HealthOmics 上的 Ready2Run 工作流程(26:34)