Biogen 的基因组解决方案使用 AWS 来推进神经系统疾病研究

2020 年

行业挑战

为了确定潜在的新疾病疗法、寻找新的基因靶点并更好地了解神经系统疾病生物学,研究员需要一种有效的方法来分析来自英国生物样本库的逾 1 PB 级数据,这是一项对 500000 名志愿者进行的长期研究,项目期长达 30 年。

Biogen 的基因组解决方案使用 AWS 来推进神经系统疾病研究(26:36)
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因为所有群组都已在使用 AWS 基础设施,所以很容易通过桶将数据移动到每个拥有 Amazon Virtual Private Cloud 的群组,以便使用这些数据。”

David Sexton
Biogen 基因组技术与信息学高级总监

Biogen 的解决方案

为了分析英国生物样本库的大量医疗数据(从外显子组测序(蛋白质编码基因区域)到血浆生物标志物和生物标记信息),Biogen 已知道其“需要有一个相匹配的信息解决方案来处理此规模的数据,”基因组技术与信息学高级总监 David Sexton 说道。为了寻求云优先解决方案,Biogen 与 AWS 合作伙伴网络(APN)中的 Amazon Web Services(AWS)高级技术合作伙伴AWS 生命科学能力合作伙伴 Databricks 合作,设计一个软件解决方案堆栈,利用 AWS 技术以高效、安全地分析数据。Amazon Elastic Compute Cloud(Amazon EC2)为 AWS Cloud 中的数据分析和堆栈维护提供支持;Amazon Simple Storage Service(Amazon S3)为项目不断扩展的 PB 级数据提供了可扩展的存储解决方案;Amazon Virtual Private Cloud(Amazon VPC)则提供了强大的安全性。

使用 AWS 的优势

Biogen 的 AWS 架构让其能够轻松地与合作伙伴共同分析数据。Sexton 表示:“因为所有群组都已在使用 AWS 基础设施,所以很容易通过桶将数据移动到每个拥有 Amazon Virtual Private Cloud 的群组,以便使用这些数据。” 凭借从其 AWS 堆栈处理的数据中收集的见解,Biogen 能够根据基因组证据重新定位其药物组合,确定新的药物靶点,并进一步揭示对阿尔兹海默病和帕金森氏症等神经系统退行性疾病的生物学基础的重要见解。


关于 Biogen

Biogen 是一家生命科学公司,致力于为人类根除神经系统疾病。自 1978 年以来,它一直引领着神经科学和生物技术,其产品组合目前涵盖八种疾病的 60 种靶向治疗。

关于 Databricks

Databricks 是 APN 中的 AWS 高级技术合作伙伴及 AWS 生命科学能力合作伙伴,它提供了一个统一的数据分析平台,使数据团队能够与数据工程和数据科学工具协作,进而加速数据驱动型创新。Databricks 还提供了一套基因组解决方案,可实现大规模的交互式基因组数据处理和分析。


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