Fauna Bio が AWS を利用して、大規模なマルチオミックデータセットを調和させ、人間の健康に関連する遺伝子を明らかにする

研究者は、人間の病気に対する標的治療を開発するために重要な特定の遺伝子を明らかにすることを目的として、大規模なマルチオミクスデータセットを調和させようとする際に、困難に直面する可能性があります。

冬眠中の動物は、極端な生理学的変化と効果的に戦います。これは、人間の病気に代わるものとして考えることができます。例えば、これらの動物は毎年 25 回の心臓発作に相当する経験をすることがありますが、組織を保護および修復できるのです。Fauna Bio は、動物の病気と闘う遺伝子を特定することにより、人間の健康に関連する遺伝子を明らかにすることを目的としています。そのために、Fauna Bio は、トランスクリプトミクス、エピゲノミクス、および進化の速度の解析を複合的に利用して、人間のための効果的な治療薬の標的となる遺伝子を明らかにします。

Fauna Bio は、これらの解析に関連するデータを保存および処理するための膨大なデータベースを蓄積してきました。「これらの解析を行って、データを AWS クラウドに保存できることに高揚感を覚えています。これにより、複数の場所から数テラバイト相当のデータに効率的にアクセスできるようになるからです」と Fauna Bio の最高技術責任者である Linda Goodman 氏は述べています。自社の研究者や協働者がこの巨大なデータセットにアクセスできるようにするために、Fauna Bio は、アマゾン ウェブ サービス (AWS) でホストされるプラットフォームを作成しました。これにより、ユーザーは、比較ゲノミクス、トランスクリプトミクス、エピゲノミクスのデータから選んで、影響を受けた関心のある組織を選択し、潜在的に開発対象となる治療の種類を指定して、結果として得られる遺伝子ネットワークの視覚的なマップを表示してこれを解析し、さらにテストや開発を行うことができます。